2000年10月，省政府批準(zhǔn)組建江蘇省疾病預(yù)防控制中心，是直屬省衛(wèi)生健康委的公益性事業(yè)單位。2002年3月以來(lái)，增掛省衛(wèi)生檢測(cè)檢驗(yàn)中心、省公共衛(wèi)生研究院。2024年1月，掛牌的省公共衛(wèi)生研究院更名為省預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院?，F(xiàn)有江蘇路172號(hào)、邁皋橋122號(hào)兩座辦公區(qū)，下設(shè)22個(gè)業(yè)務(wù)部門(mén)、15個(gè)職能部門(mén)、1個(gè)臨時(shí)部門(mén)。單位核定編制695人，在職在編549人，其中高級(jí)專業(yè)技術(shù)職稱264人、碩士研究生以上學(xué)歷312人。建有國(guó)家突發(fā)急性傳染病防控隊(duì)、國(guó)家核和輻射突發(fā)事件衛(wèi)生應(yīng)急隊(duì)2支國(guó)家級(jí)應(yīng)急隊(duì)伍。獲批江蘇省發(fā)改委 衛(wèi)生應(yīng)急工程研究中心 、江蘇省衛(wèi)生健康委 十四五科教能力提升工程流行病學(xué)職業(yè)病學(xué) 重點(diǎn)學(xué)科、 疫苗臨床評(píng)價(jià)醫(yī)學(xué)創(chuàng)新中心 和 新發(fā)突發(fā)重大傳染病病原微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 。
累計(jì)主持省部級(jí)以上科研項(xiàng)目146項(xiàng)，其中國(guó)家科技重大專項(xiàng)1項(xiàng)、科技部863計(jì)劃1項(xiàng)、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目36項(xiàng)（含優(yōu)青項(xiàng)目1項(xiàng)）、國(guó)家社會(huì)科學(xué)基金項(xiàng)目1項(xiàng)。榮獲各級(jí)各類科技獎(jiǎng)180項(xiàng)，其中省部級(jí)科技一等獎(jiǎng)4項(xiàng)、省部級(jí)其他獎(jiǎng)項(xiàng)44項(xiàng)。累計(jì)發(fā)表論文5229篇，其中SCI論文1075篇。累計(jì)發(fā)布衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)201項(xiàng)，榮獲發(fā)明專利、軟件著作等知識(shí)產(chǎn)權(quán)301項(xiàng)。
中心堅(jiān)持以習(xí)近平新時(shí)代中國(guó)特色社會(huì)主義思想為指導(dǎo)，在省委省政府和省衛(wèi)生健康委領(lǐng)導(dǎo)下，積極倡導(dǎo) 團(tuán)結(jié)、奮進(jìn)、求實(shí)、創(chuàng)新 疾控精神，履行省域傳染病疫情和突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置、實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)檢測(cè)、應(yīng)用性技術(shù)研究、公共衛(wèi)生信息統(tǒng)籌管理和大數(shù)據(jù)分析利用、對(duì)外合作交流等職能。有效應(yīng)對(duì) 非典 、新冠病毒感染疫情，救援5.12汶川特大地震，處置9.14湯山投毒、嬰幼兒毒奶粉、地溝油、小龍蝦事件，援助非洲塞拉利昂抗擊埃博拉疫情，對(duì)口支援西藏拉薩、新疆伊犁和克州，保障北京奧運(yùn)、上海世博會(huì)等重大活動(dòng)。高質(zhì)量推進(jìn)建設(shè)具有國(guó)際影響力的現(xiàn)代化疾控中心，服務(wù) 健康江蘇 ，獲中央文明委 全國(guó)文明單位 ，衛(wèi)生部等部委 抗震救災(zāi)醫(yī)藥衛(wèi)生先進(jìn)集體 ，人社部等部委 埃博拉出血熱疫情防控先進(jìn)集體 ，國(guó)家衛(wèi)生健康委 全國(guó)疾病預(yù)防控制工作先進(jìn)集體 ，原國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委、中華全國(guó)總工會(huì) 全國(guó)衛(wèi)生應(yīng)急技能競(jìng)賽團(tuán)體一等獎(jiǎng) ，中華全國(guó)總工會(huì) 全國(guó)五一勞動(dòng)獎(jiǎng)狀 等表彰200余項(xiàng)。
